製薬大手6社の年収ランキング：首位1,351万円【2026年】

上場する製薬大手6社の平均年収は、首位が中外製薬の1,351万円（2025年12月期、有価証券報告書）で、6社の幅は1,000万〜1,351万円です。国税庁「民間給与実態統計調査」令和7年分の平均給与487万円と比べると、最下位でも2倍以上になります。本記事は各社の有価証券報告書「従業員の状況」に載る平均年間給与を、転職ツリーの企業ページの値で集約したものです。

製薬大手6社の平均年収ランキング（有価証券報告書）

順位	企業	平均年収	前期比	データ年度	平均年齢	平均勤続年数	従業員数（提出会社）
1	中外製薬	1,351万円	+11.9%	2025年12月期	42.6歳	15.4年	5,104人
2	武田薬品工業	1,145万円	+3.7%	2026年3月期	44.0歳	14.8年	4,792人
3	アステラス製薬	1,132万円	+8.1%	2026年3月期	42.5歳	15.4年	4,081人
4	エーザイ	1,123万円	+6.4%	2026年3月期	44.5歳	18.5年	2,979人
5	第一三共	1,098万円	−1.5%	2026年3月期	45.0歳	19.9年	8,009人
6	大塚ホールディングス	1,000万円	−5.9%	2025年12月期	46.9歳	3.3年	224人（持株会社）

値はいずれも各社の有価証券報告書「従業員の状況」に記載された提出会社の平均年間給与を万円に換算したものです（千円単位を四捨五入）。大塚ホールディングスは純粋持株会社で、224人は管理部門の人員です。大塚製薬など事業会社の平均年収は有価証券報告書に記載がなく、大塚製薬の企業ページにも平均年収は載せていません。

順位を読む前に確認する3つの集計範囲

同じ「平均年収」でも、集計の範囲は次の3点で違います。

1. 決算期：中外製薬と大塚ホールディングスは12月期、ほかの4社は3月期です。中外製薬の1,351万円は2025年12月末、武田薬品工業の1,145万円は2026年3月末時点の値で、3カ月のずれがあります。
2. 提出会社か連結か：平均年収は提出会社（単体）の従業員だけで計算されます。第一三共は提出会社8,009人に対し連結20,171人、アステラス製薬は提出会社4,081人に対し連結14,099人で、海外子会社の社員は含みません。
3. 持株会社か事業会社か：大塚ホールディングスの1,000万円は、連結37,758人のうち持株会社に在籍する224人の平均です。平均勤続年数3.3年はグループ各社から移った人材が中心であることを示し、ほかの5社の勤続14.8〜19.9年とは構成が違います。

営業利益率と平均年収の関係

首位の中外製薬は営業利益率47.6%（2025年12月期、売上収益1兆2,579億円）で、6社の中で利益率も最も高い会社です。平均年収が前期比11.9%増と最も大きく伸びた点も、利益率と同じ向きにあります。

一方で、営業利益率と年収は単純には比例しません。武田薬品工業の営業利益率は0.1%（営業利益62億円、2026年3月期）ですが、これは訴訟引当金の計上後の値で、一過性要因を除いたCore営業利益は1兆1,725億円です。エーザイも営業利益率5.3%に対し、一過性損益を除いたコア営業利益は501億円（前期比110.7%増）で、平均年収は6.4%増えました。製薬会社は訴訟や権利の導出に伴う一時金で営業利益が大きく動くため、年収との関係は各社が本業の指標として示す利益で読むほうが実態に近くなります。

前期比で見る年収の動き

6社のうち4社が前期比で増加、2社が減少です。増加幅は中外製薬11.9%、アステラス製薬8.1%、エーザイ6.4%、武田薬品工業3.7%の順で、エーザイの1,123万円は同社の5期で最高の値です。

減少した2社は理由が異なります。第一三共の1.5%減は2025年4月に製造子会社2社を吸収合併して集計の母集団が変わった後の値、大塚ホールディングスの5.9%減は持株会社の従業員が183人から224人に増えた年の変化です。どちらも給与水準そのものが下がったと読むには根拠が足りず、集計対象の変化として読むのが妥当です。

転職先として比べるときの見方

平均年収は在籍者の平均で、中途入社の提示額ではありません。平均年齢と勤続年数を合わせて読むと、第一三共（45.0歳・19.9年）とエーザイ（44.5歳・18.5年）は新卒入社で長く勤める社員が中心の構成、中外製薬（42.6歳・15.4年）とアステラス製薬（42.5歳・15.4年）はやや若い構成です。アステラス製薬は採用者に占めるキャリア採用比率を2025年度75.7%と公表しており、6社の中で中途採用の規模を数字で確認できる数少ない例です。

職種別の相場と比べる場合は、研究職の年収ページ（賃金構造基本統計調査から算出した平均802万円、2025年）が目安になります。有価証券報告書の平均年収の定義や、持株会社と連結の差の読み方は有価証券報告書の平均年収の見方で説明しています。